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NEWS不朽情缘MG的TOPO克隆流程与注意事项
来源:孔豪羽 日期:2025-03-23二、TOPO克隆PCR产物的纯化及回收
1. 在完成PCR反应后,产物应通过琼脂糖凝胶电泳进行鉴定,以确认是否存在预期大小的DNA条带。
2. 推荐采用切胶回收法进行纯化。切胶时间建议控制在3分钟以内,以避免紫外照射对DNA的损伤。使用NanoDrop或OneDrop等仪器检测回收浓度,确保浓度达到≥30ng/μl,同时再次通过电泳确认仅存在目的DNA条带。
3. 将目的片段连接至载体。连接反应体系应按说明书要求添加,各组分的投入体积不应少于1μl,若浓度过高可先进行稀释。连接反应温度可以尝试设置为25°C或37°C,时间为5分钟。如果遇到克隆失败或假阳性问题,可适当延长时间至30分钟。
4. 感受态细胞转化与涂板操作:
1. 推荐使用DH5α或Fast-T1等化学感受态细胞进行连接产物的转化。
2. 感受态细胞不可反复冻融,建议从-80°C取出后一次性使用完毕。
3. 重组产物体积与感受态细胞体积的比例为1:10,推荐将10μl重组产物加入至100μl感受态细胞,或将5μl重组产物加入至50μl感受态细胞。
4. 热激时间应按照感受态细胞的说明书进行操作。
5. 涂板时使用的抗生素抗性应与转化载体的抗性保持一致。
6. 涉及菌液涂板,用2500×g离心3分钟后,弃去多余的LB培养基,保留100μl重悬液后全部涂板,或吸取适量涂板。
5. 单克隆菌落的PCR鉴定:
1. 从平板中挑取适中大小的单克隆菌落,避免选择尺寸过大或过小的菌落。
2. 挑选多个单克隆菌落进行鉴定分析。
3. 将挑选的菌落放入已加入10μl ddH2O的15ml或2ml EP管中,充分混匀后吸取1-2μl作为PCR反应的模板(10/20μl体系)。
4. 推荐使用一对分别位于片段和载体的上下游引物进行PCR鉴定。
6. 针对含有Amp/kana抗性的质粒进行目的片段的切胶回收。
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